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新平台篩選基因編輯工具 港大團隊開發 提升精準治療

By on June 20, 2023

原文刊於信報財經新聞EJ Tech 創科鬥室

鹼基編輯(Base Editing)可用來治療因單個鹼基突變基因而引致的疾病,例如鐮刀型細胞貧血症、家族性高膽固醇血症等。香港大學李嘉誠醫學院的研究團隊最近開發了一款新型測試平台,聲稱可同時試驗及改造數以百計鹼基編輯器,加快篩選基因編輯工具。相關研究由港大醫學院生物醫學學院副教授黃兆麟,率領博士生方凱俊及兩位博士後研發員進行。

同步試驗數百鹼基編輯器

根據港大提供資料,研究團隊開發的平台,是由早年成功研發、用來分析蛋白質工程中高階組合突變的CombiSEAL平台,以及鹼基編輯報告系統合併而成,可快速構建出數百種鹼基編輯器變體,有待進一步識別及比較其兼容性。

這些變體具有不同脫氨酶及建基於「常間回文重複序列叢集關聯蛋白」(CRISPR/Cas9)的去氧核醣核酸(DNA)識別結構域,透過平台,可以讀取每個變體的編輯效率、純度、DNA序列組成偏好,以及在人類細胞產生單一和多個鹼基轉換的偏差,有助挑選出最適用於基因治療的變體。

省時省力 如快速結賬通道

港大指出,過往進行基因治療研究時,基因編輯結果往往會因應鹼基編輯器類型、版本、目標DNA序列組成等因素而有所差異,甚至產生不理想的結果,因此研究員需要花時間及精力,逐一測試現有的幾十款鹼基編輯器性能,希望令鹼基編輯在每個治療點上有更精準的發揮,奈何目前的鹼基編輯器在多個治療點上,仍未能進行精確編輯,而創建新鹼基編輯器則動輒需花數個月甚至數年時間。

黃兆麟以商店的快速結賬通道作比喻,形容鹼基編輯器變體有如商店內的商品,團隊所研發的技術可以自動識別所有貨品並完成結賬,毋須逐件商品掃描。

研究獲政府創新科技署旗下InnoHK創新香港研發平台腫瘤及免疫學研究中心資助,結果亦已發表於科學期刊Cell Systems

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