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美實驗室召閒置電腦 助研新冠藥
By 信報財經新聞 on March 6, 2020
原文刊於信報財經新聞「StartupBeat創科鬥室」
全球深受疫情衝擊,各地專家正致力尋找有效治療法。由美國史丹福大學潘德實驗室(Pande Lab)主導的分散式計算計劃Folding@home(FAH)近日公開呼籲志願者貢獻電腦的閒置運算力,以協助研究員開發新冠病毒的靶標藥物。
分析病毒蛋白結構
FAH計劃早於2000年啟動,專注模擬蛋白質摺疊、誤折及聚合的過程,透過世界各地志願者提供的電腦閒置運算資源,進行更多的醫學研究,例如阿茲海默症(俗稱腦退化)及癌症等疾病。
該計劃過去曾研究沙士(SARS-CoV)病毒,對於同為冠狀病毒的「新冠病毒」(2019-nCoV),若能找出兩者的蛋白質結構差異,就能根據過去的研究經驗,加快對新冠病毒的蛋白結構進行建模,找出治療性抗體。
FAH連接史丹福大學伺服器
包括沙士及新冠病毒在內的冠狀病毒,表面布滿特有的刺突蛋白,當刺突蛋白與人體肺部細胞上的受體蛋白ACE2結合時,肺部便會受到病毒感染。
FAH指出,刺突蛋白會不斷擺動、摺疊及展開,並且呈現出多種形狀。研究員必須研究多種刺突蛋白的結構,才能夠找出有效防止病毒與人體受體結合ACE2的部分。
基於刺突蛋白結構的複雜性,相關研究需要龐大電腦運算力,FAH希望借用志願者電腦的閒置資源幫助計算。
志願者只要下載並安裝FAH的軟件,電腦便會連接美國史丹福大學的伺服器,取得「工作單元」(Work Units),即一種存有實驗資料的資料包;電腦處理器正在閒置時,就會根據實驗資料加以運算,完成後再傳回伺服器。
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